总公司为一般纳税人，分公司为小规模纳税人，分公司为独立核算主体，现在想把分公司注销，是不是分公司之后的业务全部合并到总公司，这样总公司的税款是不是会变高，税负增加，利润变化

- 税款方面 ​ - 增值税：分公司是小规模纳税人，征收率通常为3%（目前有优惠政策），总公司是一般纳税人，税率根据行业不同有13%、9%、6%等。若分公司有未完成的销售业务，合并到总公司后，按总公司税率计算增值税销项税额，可能会使总公司增值税应纳税额增加。但如果分公司有较多进项税额未抵扣（如取得了增值税专用发票等情况），在符合规定的情况下，可在总公司进行抵扣，从而减少总公司的应纳税额。 ​ - 企业所得税：分公司不是独立的法人主体，企业所得税由总公司汇总缴纳。分公司注销后，其资产、负债等并入总公司，在计算企业所得税时，总公司需将分公司的经营成果纳入统一核算。若分公司注销前存在未弥补的亏损，可在总公司盈利中进行弥补，从而减少总公司的应纳税额；反之，若分公司有盈利，则会增加总公司的应纳税所得额，进而增加企业所得税税款。 ​ - 税负方面 ​ - 增值税税负：一般纳税人的增值税税负受进项税额抵扣的影响较大。若分公司注销后，总公司能够取得更多的进项发票用于抵扣，或者分公司原有的进项税额可以在总公司抵扣，那么总公司的增值税税负可能会降低；反之，如果分公司的业务并入总公司后，总公司的销项税额大幅增加，而进项税额抵扣不足，增值税税负就可能会上升。例如，分公司主要从事零售业务，客户多为个人，不需要开具增值税专用发票，而总公司从事生产业务，有大量的原材料采购等进项税额，分公司注销后，其业务并入总公司，总公司的进项税额抵扣充足，增值税税负可能会降低。 ​ - 综合税负：考虑到企业所得税等其他税种，分公司注销后，总公司的综合税负变化取决于各项税种的综合影响。如果分公司的业务性质与总公司不同，例如分公司享受某些税收优惠政策，而总公司不享受，那么分公司注销后，总公司的综合税负可能会上升；反之，如果分公司的税负较高，而总公司有更多的税收筹划空间，综合税负可能会下降

补充，分公司取得的专票总公司是否可以抵扣建议在实施过程中，与主管税局进一步沟通。